归一跨界舰队驶入界外时空的第三年，已联合二十余个宇宙的和平文明，将跨界归一法则的光芒延伸至更遥远的星域。灵汐通过云航融入法则的意识共鸣，感知到界外时空的终极核心——“本源混沌域”，那里孕育着宇宙诞生之初的混沌本源，也潜藏着联盟成立以来最恐怖的敌人——“混沌本源主”。
混沌本源主是混沌能量的具象化，没有实体，如同一团覆盖百万光年的漆黑星云，周身萦绕的混沌本源能量能直接改写宇宙法则，所过之处，星系崩塌、文明湮灭。它感知到跨界归一法则的威胁，正从本源混沌域出发，试图吞噬所有宇宙的本源能量，让一切回归混沌。
“混沌本源主的力量远超之前所有敌人。”灵汐站在归一号舰桥，归一灵刃泛着凝重的七彩光芒，“它是宇宙法则的对立面，跨界归一法则虽能包容万物，却需集齐所有联合文明的本源能量，才能与之抗衡。”
跨界议会立刻发出号召，三十余个联合文明的核心舰队全速集结，将各自的本源能量注入归一跨界舰队的“宇宙归一核心”。晶灵族的晶体本源、星蓝联邦的星蓝本源、时空游牧族的时空本源……无数道不同颜色的本源能量汇聚，与跨界归一法则融合，形成一道贯穿界外时空的七彩本源光柱，归一号的归一破界炮也进化为“宇宙归一炮”，威力足以撼动混沌本源。
当混沌本源主抵达联盟防线时，界外时空的黑暗被彻底吞噬。它张开巨口，无数道混沌能量束射向联盟舰队，所过之处，时空被撕裂成无数碎片，部分文明舰队的护盾瞬间崩解，星舰化作飞灰。“渺小的文明，也敢妄图对抗本源混沌！”混沌本源主的声音震彻寰宇，混沌能量化作一只遮天蔽日的巨手，抓向归一号。
“宇宙归一·防御阵！”灵汐一声令下，所有联合舰队的本源能量与归一号的宇宙归一核心共鸣，形成一道覆盖千万里的七彩防御阵。巨手拍在阵上，爆发出惊天动地的巨响，防御阵剧烈震颤，却始终屹立不倒。灵汐纵身跃出归一号，归一灵刃注入全部宇宙归一能量，化作一道贯穿天地的七彩光刃，狠狠劈向混沌巨手。
光刃斩断巨手，混沌能量四散飞溅，却很快重新汇聚，化作无数道混沌异兽，扑向联盟舰队。凌玥、风痕、晶核长老带领各族舰队迎击，星蓝之力冻结混沌异兽，时空能量打乱其阵型，晶体能量将其困住，联盟舰队的主炮同时开火，将混沌异兽逐一净化。
“混沌本源·寂灭吞噬！”混沌本源主暴怒，周身的混沌星云疯狂收缩，化作一颗巨大的混沌核心，核心周围的时空彻底凝固，联盟舰队的行动变得迟缓，甚至部分本源能量被强行抽取。灵汐脸色一变，立刻与联合文明的核心意识建立连接：“所有文明，将本源信念注入宇宙归一核心！信念是文明的灵魂，也是混沌无法吞噬的力量！”
无数道蕴含着和平、共生、坚守的信念能量从各个文明涌出，汇入宇宙归一核心。核心爆发出耀眼的光芒，混沌的凝固时空被瞬间冲破，灵汐的归一灵刃再次暴涨，七彩光芒中融入了无数文明的信念符文：“宇宙归一·信念破混沌！”
灵汐纵身跃至混沌核心上方，归一灵刃刺入核心，信念能量与宇宙归一能量交织，在核心内部炸开。混沌本源主发出凄厉的嘶吼，混沌核心出现细密的裂痕，漆黑的混沌能量疯狂外泄，却被信念能量与归一法则强行净化，转化为纯净的宇宙本源能量。